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请教各位老师,如何提取石蜡组织的DNA

llj19971997 离线

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楼主 发表于 2012-08-02 14:31|举报|关注(1)
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 我尝试提取石蜡组织的DNA,为什么量少,而且OD值只有1.5.

请给位老师给我指点一下。关键在哪几步?

具体是8um,三张切片。二甲苯脱蜡过夜。酒精脱苯(此时在75度,20min)。用裂解液孵育1h,再加蛋白酶k至终浓度为500ug/ml过夜(55度)。平衡酚提取一次,酚/氯仿/异丙醇提取一次,氯仿/异丙醇提取一次。加入1/10的乙酸钠,二倍体积的无水乙醇,-20度过夜,离心。加70%乙醇离心,用高压灭菌的水溶解。

在整个提取过程中没有看到明显的沉淀,为什么呢?

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llj19971997 离线

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5 楼    发表于2012-08-28 08:54:08举报|引用
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我们老大同意买试剂盒,可是咨询了一下,包埋时间长就会有影响。现在包埋已经超过十年了,好像不行了。DNA提取后后期PCR有难度了。各位老师,这种蜡块是不是不适合做实验了?

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llj19971997 离线

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7 楼    发表于2012-08-31 09:22:55举报|引用
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谢谢回复。

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qthank 离线

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1 楼    发表于2012-08-08 13:38:32举报|引用
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二甲苯脱蜡不需要过夜,15秒就可以

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llj19971997 离线

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4 楼    发表于2012-08-17 08:22:48举报|引用
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谢谢3楼的老师。可是现在买的都是试剂而没有试剂盒,所以只能摸索着做了。呵呵

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荷语莲心 离线

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6 楼    发表于2012-08-30 18:00:31举报|引用
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最好使用试剂盒,Qiagen的不错。10年以上的蜡块比较难,一般蜡块保存的时间越长,得到的DNA片段越小。而且提取DNA的成功与否和质量也取决于当时固定剂和固定时间等多个因素。文献中用10年以上蜡块的也不算少,还有用25年的报道。

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寻找生命的奇迹 离线

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8 楼    发表于2013-01-10 14:26:18举报|引用
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引用 6 楼 荷语莲心 在 2012-08-30 18:00:31 的发言:

最好使用试剂盒,Qiagen的不错。10年以上的蜡块比较难,一般蜡块保存的时间越长,得到的DNA片段越小。而且提取DNA的成功与否和质量也取决于当时固定剂和固定时间等多个因素。文献中用10年以上蜡块的也不算少,还有用25年的报道。

蜡块保存时间较长那可以加大模板的量或选用灵敏度比较高的方法检测。


 

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狭路相逢,勇者胜

llj19971997 离线

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2 楼    发表于2012-08-10 14:18:24举报|引用
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谢谢。

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cy3163 离线

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3 楼    发表于2012-08-10 15:03:25举报|引用
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用DNA提取试剂盒吧,天根的、QIAGEN的都行。试剂盒里有详细的步骤。

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