DNA倍体分析速度的影响 - 华夏病理网论坛

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楼主发表于 2015-11-02 09:31|举报|关注(0)
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影响DNA倍体分析速度的因素有很多，总的来说，分为软件算法、硬件质量、计算机配置、标本质量等4个方面。。标本质量是其中最重要的一环，直接影响其它三个方面，造成标本分析速度上的巨大差异。

1.标本细胞数量太少。标本细胞数量太少，可能会造成两种后果。一：扫描速度比正常标本快很多，二：扫描速度比正常标本慢很多。听起来似乎很矛盾，但它确实同时存在。

比正常标本快，是因为细胞数量少了，需要计算的细胞数量少，计算机行有余力，一个视野刚刚扫描完，细胞就已经分析完了，当然速度就快了。

比正常标本慢，那是因为细胞数量少了，有可能产生大量空白视野，空白视野是无法聚焦的，谁也不知道细胞在哪个地方。这样计算机就会花费大量的时间去寻找细胞，甚至会跑焦。速度自然就慢了。

比正常标本慢，还有一种可能是，正常标本也许扫描一半的视野就收集了足够多的细胞，扫描结束了。而细胞数量不足的标本，则需要扫描完整张玻片，花费的时间自然要长一些。

因此，细胞数量少也要看情况。要看和什么样的标本对比。

2.细胞数量多。细胞数量多，也要看情况。

细胞数量多，但是还在计算机承受范围以内。据我的经验，按照目前的计算机配置，细胞总数在5万以内（不是上皮5万，也许30万细胞里面只有1万上皮，但是计算机要计算的是30万，1万是计算的结果）。计算机能够流畅运行。此时，如果5万细胞里面上皮比例很高，2~3分钟就能结束扫描，如果上皮比例很低，大约6~7分钟完成全片扫描。

细胞数量多，超出计算机处理速度。此时会造成大量未分析的细胞积压，就像交通阻塞一样，速度会越来越慢，个别情况下直至死机。根据计算机之间的差异，这个细胞数量在20万~50万之间不等。

细胞数量介于流畅运行与大量积压之间的，则扫描时间不同程度延长，大约在10分钟左右。

3，标本很厚。如果细胞制片很厚，那么计算机在聚焦的时候会感觉每一层都是清晰的，都有大量细胞，哪一层才是正确的呢，这时它会不停的相互对比，以找出它认为最合适的一层，无形中拖慢了速度。然后扫描下来的细胞都是成团成块的，需要花费大量的精力去切割与分析。速度更慢。因此，标本过厚速度也会下降。

4.染色IOD值不正常。IOD值不正常，不管快慢，结果都是不准确的，碰到这种就不用扫了。