一、 杂交前准备
(一)DEPC水
DEPC水是经DEPC处理过的灭菌蒸馏水。DEPC即二乙基焦碳酸酯(diethylprocarbonate),可灭活各种蛋白质,是RNA酶的强抑制剂。原位杂交在杂交及其以前的各步处理中,所有液体试剂都应经DEPC处理。方法是:取市售DEPC 1ml,加入1L待处理水(蒸馏水等)中,经猛烈振摇后,于室温静止数小时,然后高压灭菌,以除去降解DEPC(DEPC分解为C02和乙醇)。试剂可直接加入DEPC,终浓度一般为0.1%-0.4%,原则上在杂交及其以前的步骤中,所有液体试剂均需用DEPC处理,或用DEPC水配制,包括乙醇的稀释。此外,接触标本以及标本有关的容器的洗涤也需DEPC水洗涤。
注意:(1)DEPC是一种潜在致癌物质,操作中应通风条件下进行,避免皮肤接触。(2)含有Tris缓冲液的溶液中不能加入DEPC。
(二)载波片的处理
组织原位杂交,常在载玻片上进行,故载玻片的洗涤至关重要,必须保持清洁,并且不能任何核酸酶的污染。处理方法如下:
(1)先经洗衣粉浸泡过夜,次日自来水流水冲洗后,泡酸数小时以上,取出后再用流水、双蒸水冲洗2—3次,置160℃以上烤箱中烘烤4h以上,或经15磅高压灭菌20min。经以上处理可清除载片上的核酸酶。
(2)HCl处理法
玻片在室温下于1mol/L HCl中浸泡30min;DEPC水中洗片;95%乙醇洗片;空气中干燥。重复上述过程,铝箔包好备用。
(三)载片的包被
1.黏附剂有:
(1)多聚赖氨酸(Poly-L-Lysine, PLL)
储备液(0.5%)
PLL 25mg
DEPC水 5ml
按上述剂量充分混合,即为浓度为5mg/m1(0.5%)的PLL液。常分装成1m1的包装,
-20℃存放。该液为储备液,可反复冻融,无明显影响。用前充分混合。
工作液(0.01%):
0.5% PLL 1ml
DEPC水 50ml
充分混合,静止待气泡消失。
(2)明胶液
明胶 2.4g
甲明矾 2.4g
DEPC水 1000ml
配法:先称取明胶溶于500—800ml DEPC水中,加热搅拌助溶,待明胶完全溶解以后,加入甲明矾溶解后即可使用。注意,包被玻片时,明胶液温度最好保持在60℃左右,效果最佳。方法同PLL包被玻片。
2.多聚赖氨酸包被玻片的制作方法(其它包被剂相同)
(1)将事先准备好的经160℃以上烘烤,并冷却至室温的玻片(载片或盖片),在0.05%(也
有用0.1%)的PLL液中上下浸蘸几下,分散开竖放在架子上,于空气中自然干燥,4℃备用。
注意:①浸蘸时,务必使整个玻片完全浸于液体中,否则,包被不完全会产生标本脱落现象;②干燥过程中注意避免尘埃污染;③按上法处理的玻片通常可存放一定时间(室温1月以上,4℃更长),但仍建议尽早使用。
二、操作过程
以针对人Cathepsin B靶基因的mRNA序列为例。本试剂盒采用针对Cathepsin B的寡核苷酸探针,经地高辛标记。 可以检测出常规福尔马林固定,石蜡包埋标本的Cathepsin B之mRNA序列。针对Cathepsin B靶基因的mRNA序列为:
(1) 5’—CATCC CTCCC TGTGA GCACC ACGTC AACGG—3’;
(2) 5’—GGCCA TGCCA TCCGC ATCCT GGGCT GGGGA—3’;
(3) 5’—GCTGG AATTC CACGC ACCGA TCAGT ACTGG—3’;
大鼠、小鼠和人的序列有7bp/90bp不同。
适用种属:人、大鼠、小鼠组织。
试剂盒中内容
1.胃蛋白酶(×10;Pepsin ) 2m1; 2.预杂交液2m1; 3.以CATHEPSIN B寡核苷酸探针杂交液 2m1; 4.封闭液 5m1; 5.生物素化鼠抗地高辛 5m1;
6.SABC—POD 5m1;7.生物素化过氧化物酶 5m1。
用户自备试剂:原位杂交专用盖玻片;Poly-L-Lysine ; DEPC;20%甘油;缓冲液(3%柠檬酸,2×SSC,0.5×SSC,0.2×SSC, 0.5×PBS)
(一)、石蜡切片
准备工作液:缓冲液的配备
3%柠檬酸——100ml蒸馏水中加柠檬酸(C6K807·H20)3g,PH2.O左右。
2×SSC——l000ml蒸馏水中加氯化钠17.6g,柠檬酸三钠(C6H507Na3·2H20,分294)8.8g
0.5×SSC——300ml蒸馏水加l00ml 2×SSC即可。
0.2×SSC——270ml蒸馏水加30ml 2×SSC即可。
20%甘油——20ml甘油加80ml蒸馏水即可。
0.5M PBS一一l000ml蒸馏水加氯化钠30g, Na2HP04·12H20 6g, NaH2PO4·2H2O
0.4g,PH7.2—7.6。
如果有条件的话,应尽可能地采用新鲜标本。标本离体后,及时予以固定。固定液为4%多聚甲醛/0.1M PBS(PH7.0—7.4),含有l/1000DEPC。标本较大时用刀片切成厚度不超过4mm的小块,固定2小时即可,较大的标本固定不要超过4小时。某些组织对过度固定尤其敏感,如动物大脑,固定时间一定不要超过2小时。
1.常规脱水、浸蜡、包埋。切片厚度6-8μm。
2.玻片的处理:一般采用多聚赖氨酸。
3.石蜡切片经常规脱蜡至水。3%H202室温处理10分钟。蒸馏水洗涤2次。
4.暴露mRNA核酸片段:
切片上滴加3%柠檬酸新鲜稀释的胃蛋白酶(1ml 3%柠檬酸加2滴浓缩型胃蛋白酶,混匀),37℃消化10-60分钟。可以比较不同的消化时间,例如10分钟,20分钟,30分钟和60分钟,以找到最佳的消化时间。0.5M PBS洗3次×5分钟。
5.预杂交:湿盒的准备一干的杂交盒底部加20%甘油20ml以保持湿度。按每张切片20μl加预杂交液。恒温箱37-40℃ 2-4小时。吸取多余液体,不洗。
6.杂交——按每张切片20 μl杂交液,加在切片上。将原位杂交专用盖玻片的保护膜揭开后,盖在切片上。恒温箱40-42℃杂交过夜c
7.杂交后洗涤:揭掉盖玻片,30-37℃左右水温的2×SSC洗涤5分钟×2次;0.5×SSC洗涤15分钟×1次;0.2×SSC洗涤15分钟×1次(如果有非特异性染色,重复0.2×SSC洗涤15分钟×l-2次)。
8.滴加封闭液:37℃30分钟。甩去多余液体,不洗
9.滴加生物素化鼠抗地高辛: 37℃60分钟或20℃左右120分钟。0.5M PBS洗5分钟×4次。勿用其它缓冲液和蒸馏水洗涤。
10.滴加SABC:37℃20分钟或20℃左右30分钟。0.5M PBS洗5分钟×3次。勿用其它缓冲液和蒸馏水洗涤。
11.滴加生物素化过氧化物酶:37℃20分钟或20℃左右30分钟。0.5M PBS洗5分钟×4次。
12.DAB显色:使用DAB显色试剂盒,用lml蒸馏水加显色剂A,B,C各一滴,混匀,加至标本上。一般显色20-30分钟。若无背景出现则可继续显色。也可自配DAB显色剂后显色。充分水洗。
13.必要时苏木素复染,充分水洗。
14.酒精脱水,二甲本透明,封片。
(二)、培养细胞和冰冻切片
注意:最重要的是及时固定,并在固定液中加入0.1%的DEPC处理,以抑制RNA酶对mRNA的分解作用。此外,过度固定对原位杂交有明显的不利影响。
1.玻片的处理:一般采用多聚赖氨酸。切片厚度20 μm。
2.细胞在多聚赖氨酸处理的盖玻片上进行培养,条件为37℃和5%的CO2,所用培养基为Dulbecco基础培养基。细胞长好后O.1M PBS(PH7.4)洗2分钟×3次。
3.培养细胞和冰冻切片均可用下述方法固定:固定液为4%多聚甲醛/0.1M PBS(PH7.2—7.4),含有l/l000 DEPC。室温固定30—60分钟。蒸馏水充分洗涤洗涤,干燥后-20℃冰冻可保存2周以上。
4.新鲜配制0.5%H202/甲醇室温处理30分钟以灭活内源性过氧化物酶。蒸馏水洗涤3次。
5.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%柠檬酸新鲜稀释的胃蛋白酶(1ml 3%柠檬酸加2滴浓缩型胃蛋白酶,混匀),37℃消化30—120秒钟。有时也可以不消化。0.5M PBS洗3次×5分钟。蒸馏水洗1次。
其余步骤同上5—14。
一、 杂交前准备
(一)DEPC水
DEPC水是经DEPC处理过的灭菌蒸馏水。DEPC即二乙基焦碳酸酯(diethylprocarbonate),可灭活各种蛋白质,是RNA酶的强抑制剂。原位杂交在杂交及其以前的各步处理中,所有液体试剂都应经DEPC处理。方法是:取市售DEPC 1ml,加入1L待处理水(蒸馏水等)中,经猛烈振摇后,于室温静止数小时,然后高压灭菌,以除去降解DEPC(DEPC分解为C02和乙醇)。试剂可直接加入DEPC,终浓度一般为0.1%-0.4%,原则上在杂交及其以前的步骤中,所有液体试剂均需用DEPC处理,或用DEPC水配制,包括乙醇的稀释。此外,接触标本以及标本有关的容器的洗涤也需DEPC水洗涤。
注意:(1)DEPC是一种潜在致癌物质,操作中应通风条件下进行,避免皮肤接触。(2)含有Tris缓冲液的溶液中不能加入DEPC。
(二)载波片的处理
组织原位杂交,常在载玻片上进行,故载玻片的洗涤至关重要,必须保持清洁,并且不能任何核酸酶的污染。处理方法如下:
(1)先经洗衣粉浸泡过夜,次日自来水流水冲洗后,泡酸数小时以上,取出后再用流水、双蒸水冲洗2—3次,置160℃以上烤箱中烘烤4h以上,或经15磅高压灭菌20min。经以上处理可清除载片上的核酸酶。
(2)HCl处理法
玻片在室温下于1mol/L HCl中浸泡30min;DEPC水中洗片;95%乙醇洗片;空气中干燥。重复上述过程,铝箔包好备用。
(三)载片的包被
1.黏附剂有:
(1)多聚赖氨酸(Poly-L-Lysine, PLL)
储备液(0.5%)
PLL 25mg
DEPC水 5ml
按上述剂量充分混合,即为浓度为5mg/m1(0.5%)的PLL液。常分装成1m1的包装,
-20℃存放。该液为储备液,可反复冻融,无明显影响。用前充分混合。
工作液(0.01%):
0.5% PLL 1ml
DEPC水 50ml
充分混合,静止待气泡消失。
(2)明胶液
明胶 2.4g
甲明矾 2.4g
DEPC水 1000ml
配法:先称取明胶溶于500—800ml DEPC水中,加热搅拌助溶,待明胶完全溶解以后,加入甲明矾溶解后即可使用。注意,包被玻片时,明胶液温度最好保持在60℃左右,效果最佳。方法同PLL包被玻片。
2.多聚赖氨酸包被玻片的制作方法(其它包被剂相同)
(1)将事先准备好的经160℃以上烘烤,并冷却至室温的玻片(载片或盖片),在0.05%(也
有用0.1%)的PLL液中上下浸蘸几下,分散开竖放在架子上,于空气中自然干燥,4℃备用。
注意:①浸蘸时,务必使整个玻片完全浸于液体中,否则,包被不完全会产生标本脱落现象;②干燥过程中注意避免尘埃污染;③按上法处理的玻片通常可存放一定时间(室温1月以上,4℃更长),但仍建议尽早使用。
二、操作过程
以针对人Cathepsin B靶基因的mRNA序列为例。本试剂盒采用针对Cathepsin B的寡核苷酸探针,经地高辛标记。 可以检测出常规福尔马林固定,石蜡包埋标本的Cathepsin B之mRNA序列。针对Cathepsin B靶基因的mRNA序列为:
(1) 5’—CATCC CTCCC TGTGA GCACC ACGTC AACGG—3’;
(2) 5’—GGCCA TGCCA TCCGC ATCCT GGGCT GGGGA—3’;
(3) 5’—GCTGG AATTC CACGC ACCGA TCAGT ACTGG—3’;
大鼠、小鼠和人的序列有7bp/90bp不同。
适用种属:人、大鼠、小鼠组织。
试剂盒中内容
1.胃蛋白酶(×10;Pepsin ) 2m1; 2.预杂交液2m1; 3.以CATHEPSIN B寡核苷酸探针杂交液 2m1; 4.封闭液 5m1; 5.生物素化鼠抗地高辛 5m1;
6.SABC—POD 5m1;7.生物素化过氧化物酶 5m1。
用户自备试剂:原位杂交专用盖玻片;Poly-L-Lysine ; DEPC;20%甘油;缓冲液(3%柠檬酸,2×SSC,0.5×SSC,0.2×SSC, 0.5×PBS)
(一)、石蜡切片
准备工作液:缓冲液的配备
3%柠檬酸——100ml蒸馏水中加柠檬酸(C6K807·H20)3g,PH2.O左右。
2×SSC——l000ml蒸馏水中加氯化钠17.6g,柠檬酸三钠(C6H507Na3·2H20,分294)8.8g
0.5×SSC——300ml蒸馏水加l00ml 2×SSC即可。
0.2×SSC——270ml蒸馏水加30ml 2×SSC即可。
20%甘油——20ml甘油加80ml蒸馏水即可。
0.5M PBS一一l000ml蒸馏水加氯化钠30g, Na2HP04·12H20 6g, NaH2PO4·2H2O
0.4g,PH7.2—7.6。
如果有条件的话,应尽可能地采用新鲜标本。标本离体后,及时予以固定。固定液为4%多聚甲醛/0.1M PBS(PH7.0—7.4),含有l/1000DEPC。标本较大时用刀片切成厚度不超过4mm的小块,固定2小时即可,较大的标本固定不要超过4小时。某些组织对过度固定尤其敏感,如动物大脑,固定时间一定不要超过2小时。
1.常规脱水、浸蜡、包埋。切片厚度6-8μm。
2.玻片的处理:一般采用多聚赖氨酸。
3.石蜡切片经常规脱蜡至水。3%H202室温处理10分钟。蒸馏水洗涤2次。
4.暴露mRNA核酸片段:
切片上滴加3%柠檬酸新鲜稀释的胃蛋白酶(1ml 3%柠檬酸加2滴浓缩型胃蛋白酶,混匀),37℃消化10-60分钟。可以比较不同的消化时间,例如10分钟,20分钟,30分钟和60分钟,以找到最佳的消化时间。0.5M PBS洗3次×5分钟。
5.预杂交:湿盒的准备一干的杂交盒底部加20%甘油20ml以保持湿度。按每张切片20μl加预杂交液。恒温箱37-40℃ 2-4小时。吸取多余液体,不洗。
6.杂交——按每张切片20 μl杂交液,加在切片上。将原位杂交专用盖玻片的保护膜揭开后,盖在切片上。恒温箱40-42℃杂交过夜c
7.杂交后洗涤:揭掉盖玻片,30-37℃左右水温的2×SSC洗涤5分钟×2次;0.5×SSC洗涤15分钟×1次;0.2×SSC洗涤15分钟×1次(如果有非特异性染色,重复0.2×SSC洗涤15分钟×l-2次)。
8.滴加封闭液:37℃30分钟。甩去多余液体,不洗
9.滴加生物素化鼠抗地高辛: 37℃60分钟或20℃左右120分钟。0.5M PBS洗5分钟×4次。勿用其它缓冲液和蒸馏水洗涤。
10.滴加SABC:37℃20分钟或20℃左右30分钟。0.5M PBS洗5分钟×3次。勿用其它缓冲液和蒸馏水洗涤。
11.滴加生物素化过氧化物酶:37℃20分钟或20℃左右30分钟。0.5M PBS洗5分钟×4次。
12.DAB显色:使用DAB显色试剂盒,用lml蒸馏水加显色剂A,B,C各一滴,混匀,加至标本上。一般显色20-30分钟。若无背景出现则可继续显色。也可自配DAB显色剂后显色。充分水洗。
13.必要时苏木素复染,充分水洗。
14.酒精脱水,二甲本透明,封片。
(二)、培养细胞和冰冻切片
注意:最重要的是及时固定,并在固定液中加入0.1%的DEPC处理,以抑制RNA酶对mRNA的分解作用。此外,过度固定对原位杂交有明显的不利影响。
1.玻片的处理:一般采用多聚赖氨酸。切片厚度20 μm。
2.细胞在多聚赖氨酸处理的盖玻片上进行培养,条件为37℃和5%的CO2,所用培养基为Dulbecco基础培养基。细胞长好后O.1M PBS(PH7.4)洗2分钟×3次。
3.培养细胞和冰冻切片均可用下述方法固定:固定液为4%多聚甲醛/0.1M PBS(PH7.2—7.4),含有l/l000 DEPC。室温固定30—60分钟。蒸馏水充分洗涤洗涤,干燥后-20℃冰冻可保存2周以上。
4.新鲜配制0.5%H202/甲醇室温处理30分钟以灭活内源性过氧化物酶。蒸馏水洗涤3次。
5.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%柠檬酸新鲜稀释的胃蛋白酶(1ml 3%柠檬酸加2滴浓缩型胃蛋白酶,混匀),37℃消化30—120秒钟。有时也可以不消化。0.5M PBS洗3次×5分钟。蒸馏水洗1次。
其余步骤同上5—14。