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北京地坛医院病理科 滕晓英博士
用Trizol从石蜡组织中提取RNA的方法
实验前需要准备的试剂
氯仿、异丙醇、75%乙醇(用RNase-free水配制)、RNase-free的水。
操作步骤
1. 切片、脱蜡及消化
a. 将10张5μm厚连续切片(切片机和刀片均经75%乙醇溶液消毒2次)的蜡膜放于2ml的消毒离心管里,加入1.5ml 二甲苯,55℃孵育10min,室温9000r/min离心8min,重复一次。
b. 加入1.5ml无水乙醇室温放置10min,4℃9000r/min离心8min,重复2次,弃上清。
c. 加细胞裂解液250μl,混匀,加蛋白酶K 50μl,55℃水浴过夜。
d. 95℃ 7min灭活蛋白酶K,4℃ 8000r/min离心,弃沉淀。
e. 加入1ml TRIzol。
2.分层(Phase Separation)
a. 样品加入TRIzol后,室温放置5min,使样品充分裂解。
注:如不进行下一步操作,样品可放入-70℃长期保存。
b. 每1ml TRIzol加入200μl氯仿,剧烈振荡混匀后室温放置3-5 min使其自然分相。
3.RNA沉淀(RNA Precipitation)
a. 4℃ 12,000rpm离心10-15min。样品会分成三层:黄色的有机相,中间层和无色的水相,RNA主要在水相中,把水相(通常可吸取550μl)转移到新管中。
注:小心吸取水相,千万不要吸取中间界面,否则将导致RNA样品中有DNA污染。
b. 在上清中加入等体积冰冷的异丙醇,室温放置10-20min。4℃ 12,000 rpm离心10min,弃上清,RNA沉淀于管底。
4.RNA漂洗(RNA Wash)
a. RNA沉淀中加入1ml 75%乙醇(用RNase-free水配制),温和振荡离心管,悬浮沉淀。每1ml TRIzol加入1ml 75%乙醇。
b. 4℃ 5,000-8,000 rpm离心1-2min,弃上清;短暂快速离心,用移液器小心吸弃上清,注意不要吸弃沉淀。室温放置1-2分钟晾干沉淀。
注:RNA样品不要过于干燥,否则很难溶解。
5. 溶解RNA(Redissolving the RNA)
沉淀中加入50-100μl RNase-free水,轻弹管壁,以充分溶解RNA,-70℃保存。
注意事项
1. 经常更换手套。因为皮肤经常带有细菌,可能导致RNase污染。
2. RNA在TRIzol试剂中不会被RNase污染,但在氯仿分相后的上清中已经没有了RNase的抑制剂,所以分相后的所有操作要特别小心,保证使用的离心管和枪头都是RNase-free的。
3. RNase-free水的配制方法:将水加入干净的玻璃瓶中,加入DEPC至终浓度0.1%(v/v),放置过夜,高压灭菌;RNase-free的塑料和玻璃器皿处理方法:玻璃器皿可在150℃烘烤4小时;塑料器皿可在0.5M NaOH中浸泡10分钟,然后用DEPC水彻底清洗,再灭菌,即可去除RNase。
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