为了实现《中华病理学杂志》期刊资源的有效数字化传播，同时保护这些数字资源在网络链接中的知识产权和网络传播权，2009年起中华病理学杂志纸版期刊和数字化期刊将全部标注数字对象惟一标识符（DOI）。
《中华病理学杂志》从2009年第1期开始，除消息类稿件外，其他文章均标注DOI，标注于每篇文章首页脚注的第1项，由编辑进行标注。参照DOI 的编码方案（美国标准ANSI/NISO Z39.84-2000）和中华医学会杂志社有关规定，《中华病理学杂志》DOI标注规则为：DOI：统一前缀/学会标识.信息资源类型.杂志ISSN.年.期.论文流水号。即：DOI：10.3760/cma.j.issn.0529-5807.yyyy.nn.zzz。各字段释义如下：“10.3760”为中华医学会系列杂志统一前缀；“cma”为中华医学会标识；“j”为journal缩写，代表信息资源类别为期刊；“issn. 0529-5807”为《中华病理学杂志》ISSN号码；“yyyy”为4位出版年份；“nn”为期号；“zzz”为本期论文流水号。
DOI被形象地称为“数字资源的条形码”，独立于数字资源的物理位置、复本数量、应用系统和存取协议，是为数字对象提供永久和惟一的逻辑标识符。它可以让使用者直接由此链接到出版商的数据库、文献、摘要甚至是全文，使得识别码可以直接指引到出版物本身，使国内外各种来源的各种类型的学术信息实现互链互通。随着DOI的普及，我们可基于其分析系统来建设一种新的科技评价体系，分析高被引频次作者、单位和论文等相关信息，从而可以了解各个领域学术研究的热点、影响和趋势，以及研究者在本研究领域的影响力及最新研究成果。通过DOI之间的互相操作，实现动态的、开放的知识链接，整体提升包括期刊在内的数字资源的使用率，为读者提供更好的服务；进而，逐步提高中国期刊的被引率，提升中国精品期刊在国际上的影响度和显示度；最终，有助于建立一个与世界接轨的、永久的、开放互动、成员主动参与、覆盖主要学术研究信息领域的知识链接系统，推动数字期刊的发展和繁荣。
