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错配修复蛋白是用于筛查林奇综合征的,在伴随诊断中可用于检测微卫星不稳定性病例组,目前常用于结肠癌,结果同预后及用药相关。常用的错配修复蛋白有四个MLH1、PMS2、MSH2和MSH6,因为它们是两两配对的,MLH1、PMS2一对,MSH2和MSH6为一对,在肿瘤中为细胞核表达,如果四个标记物在肿瘤中都阳性表示该疾病为微卫星稳定性病例,如果有1个标记物表达缺失(间质中淋巴细胞可以作为阳性对照)为低频度微卫星不稳定性病例,如果发现2个或两个以上标记物缺失表示为高频度微卫星不稳定性病例。