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- microarry 技术的临床应用
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微阵列（microarray）或生物芯片技术是随着“人类基因组计划”的进展而发展起来的分子生物学的又一项里程碑式的重大技术革新，它是融微电子学、生物学 、物理学、化学和计算机科学于一体，通过平面微细加工技术在固相表面构建的微流体分析单元和系统的技术。其工作原理与经典的核酸分子杂交方法(southern、northern)一致，是把大量已知序列探针集成在同一个基片(如玻片、膜)，经过标记的若干靶核苷酸序列与芯片特定位点上的探针杂交，通过检测杂交信号，对生物细胞或组织中大量的基因信息进行分析。其突出的特点在于高度并行性、多样性、微型化和自动化。基因芯片可在单个芯片中同时进行样品的多参数或多个样本的同一参数分析，可大大的提高实验的进程和检测的效率。目前microarray在临床上的应用越来越广泛，下面简要介绍几种在临床上应用较多的产品：①AmpliChip CYP450：第一个被FDA批准的基于基因型的诊断检测，其主要检测病人两个多态性频率较高的细胞色素P450（CYP）基因：CYP2D6，CYP2C19。这两种基因大约可调控将近25%的常见的药物的代谢，该检测主要检测CYP2D6基因上的29个多态性和突变位点、CYP2C19基因上的2个多态性位点。依据患者CYP2D6和CYP2C19基因型的不同，可分为：较差代谢（代谢较慢或不代谢），中间代谢（代谢慢，使用正常剂量患者体内药物浓度较高），正常代谢（药物反应与预期相同），超速代谢（代谢速度较快，无药物反应）。通过该检测，临床医生可根据病人的基因型而给予合适的药物和剂量，而达到较佳的治疗效果，该检测一生只需一次，但该检测所存在的问题是所检测的基因型并不能覆盖所有的表型，如由CYP2D6基因扩增所引起的超代谢，另该检测检测不到稀有的基因型和未发现的基因型。②MammaPrint® 乳腺癌检测：约有65%的诊断为浸润性乳腺癌的患者在其初始诊断时无淋巴结转移，这些患者中约有85%在10年内无远处转移的风险。因临床医生无法确定那些病人具有高转移、复发风险，对大多数病人均采用相对无特异性的细胞毒化疗或激素治疗，因而在制定治疗方案前预知病人复发的风险，便可依据其复发风险采取不同的治疗方案。MammaPrint®是第一个由FDA批准的，基于基因表达的预后检测项目，其可预测小于61岁的淋巴结阴性的Ⅰ-Ⅱ乳腺癌患者远处转移风险。该检测主要通过检测乳腺癌患者手术切除标本中70个基因的表达水平来预测患者的复发风险，由Agendia公司研发。③ Pathwork ™Tissue of Origin Test: 对任何肿瘤而言，正确的诊断肿瘤的组织起源对合适的治疗方案的选择非常关键，采用传统的病理技术，据统计大约会有5-10%的肿瘤会被归错。Pathwork ™Tissue of Origin Test是基于基因表达的针对低分化或未分化的组织诊断组织起源的诊断技术。该技术采用将患者近2000种基因的表达信息与同贮存于数据库中的恶性肿瘤类型的遗传信息进行对比，通过其所建立算法和评分标准确定患者肿瘤类型，目前该技术平台已经可以检测出膀胱癌、乳腺癌、结直肠癌、胃癌、肝细胞癌、肾癌、非小细胞肺癌、非霍奇金淋巴瘤、黑色素瘤、卵巢癌、胰腺癌、前列腺、Scaroma、睾丸生殖细胞癌和甲状腺癌等15种常见肿瘤类型的组织学起源，该检验的准确性非常高，近似于病理学专家采用现有标准对肿瘤进行分型所能达到的准确性。该检测为FDA-clear项目，采用Affymetrix –based PathChip™, 由PathWork Diagnostics研究开发
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